Seqüencien el genoma d'un important patogen del blat
El Servei de Recerca Agrícola dels Estats Units (ARS són les sigles en anglès) ha seqüenciat el genoma complet del patogen "Mycosphaerella graminicola", una malaltia que afecta el blat i causa pèrdues significatives en el seu rendiment. Gràcies a aquest descobriment, els investigadors ja compten amb les eines necessàries per mitigar els danys causats per aquest patogen en els cultius de blat, que poden arribar afectar el 50 per cent de la collita si els productors no utilitzen fungicides.
El patogen, anomenat Mycosphaerella graminicola, té un període silenciós molt llarg, durant el qual es nodreix de la planta viva i eludeix les seves defenses naturals. Abans del descobriment, els científics no comprenien suficientment com l'organisme infectava la planta de blat, o com la planta podia resistir el patogen. La seqüenciació del genoma del patogen però, podria ajudar a contestar algunes d'aquestes preguntes.
"Molts patògens infecten les plantes hostesses penetrant les parets cel·lulars de la planta", ha informat el patòleg de plantes Stephen Goodwin, que treballa a la Unitat d'Investigació de Producció de Cultius i Control de Plagues mantinguda per l'ARS. "Però aquest organisme creix en les obertures naturals de la planta, anomenades estomes, que la planta normalment fa servir per a l'intercanvi de gasos. Després el patogen creix del mig de les parets cel·lulars sense provocar les reaccions de defensa per parar la infecció ", ha afegit.
El patogen M. graminicola utilitza la patogenicitat del sigil, és a dir, la capacitat d'infectar la planta hostessa sense causar una reacció defensiva adequada per la planta. El patogen passa pel seu "període silenciós" i després comença una etapa de patogenicitat. "No sabem el que passa durant el canvi de l'etapa latent a l'etapa patogènica", ha dit Goodwin, però "la seqüenciació del genoma permet als científics a estudiar l'expressió de tots els gens involucrats en el període de transició".
Goodwin ha dirigit el projecte de seqüenciació, juntament amb Igor V. Grigoriev, de l'Institut Conjunt del Genoma del Departament d'Energia dels EUA en Walnut Creek, Califòrnia, i Gert H.J. Kema, de Recerca Internacional de Plantes en Wageningen en els Països Baixos. El grup internacional també ha inclòs científics d'Austràlia, Brasil, França, Alemanya, Iran, Mèxic, Suïssa, i el Regne Unit.